Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc38Q8CDN8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc38Q8CDN8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc38Q8CDN8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms