Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ufl1Q8CCJ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ufl1Q8CCJ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms