Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16223Q8CBM3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm16223Q8CBM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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