Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn3Q8CBC6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrn3Q8CBC6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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