Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nhsl1Q8CAF4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nhsl1Q8CAF4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nhsl1Q8CAF4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms