Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg4aQ8C9S8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atg4aQ8C9S8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg4aQ8C9S8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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