Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp20Q8C6M1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp20Q8C6M1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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