Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef5Q8C0Q9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rapgef5Q8C0Q9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms