Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SowahcQ8C0J6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SowahcQ8C0J6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SowahcQ8C0J6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SowahcQ8C0J6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms