Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms