Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube3dQ8BX13 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube3dQ8BX13 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Ube3dQ8BX13 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Ube3dQ8BX13 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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