Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtpaQ8BWP5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtpaQ8BWP5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms