Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Triml1Q8BVP1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Triml1Q8BVP1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Triml1Q8BVP1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Triml1Q8BVP1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms