Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx17Q8BVL3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx17Q8BVL3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms