Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep55Q8BT07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cep55Q8BT07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms