Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rd3Q8BRE0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rd3Q8BRE0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms