Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abraxas1Q8BPZ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abraxas1Q8BPZ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abraxas1Q8BPZ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms