Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hirip3Q8BLH7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hirip3Q8BLH7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms