Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dupd1Q8BK84 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dupd1Q8BK84 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dupd1Q8BK84 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms