Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp1Q8BJQ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp1Q8BJQ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms