Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcal1Q8BJL0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms