Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco3Q8BH01 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco3Q8BH01 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmco3Q8BH01 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms