Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG22

Clca2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca2Q8BG22 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clca2Q8BG22 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clca2Q8BG22 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clca2Q8BG22 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clca2Q8BG22 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clca2Q8BG22 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clca2Q8BG22 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clca2Q8BG22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clca2Q8BG22 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms