Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctdspl2Q8BG15 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctdspl2Q8BG15 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdspl2Q8BG15 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctdspl2Q8BG15 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.6 ms