Protein–RNA interactions for Protein: Q811W2

Cyp26b1, Cytochrome P450 26B1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26b1Q811W2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp26b1Q811W2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp26b1Q811W2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp26b1Q811W2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26b1Q811W2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26b1Q811W2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26b1Q811W2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26b1Q811W2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26b1Q811W2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26b1Q811W2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms