Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cracr2bQ80ZJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms