Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amigo1Q80ZD8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Amigo1Q80ZD8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amigo1Q80ZD8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amigo1Q80ZD8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amigo1Q80ZD8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amigo1Q80ZD8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amigo1Q80ZD8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amigo1Q80ZD8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amigo1Q80ZD8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms