Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srrm3Q80WV7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm3Q80WV7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms