Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC46.64■■■■■ 5.06
NischQ80TM9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC46.62■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC46.58■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC46.57■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
NischQ80TM9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
NischQ80TM9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
NischQ80TM9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
NischQ80TM9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
NischQ80TM9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
NischQ80TM9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
NischQ80TM9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
NischQ80TM9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
NischQ80TM9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC46.45■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
NischQ80TM9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.4■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
NischQ80TM9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC46.33■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
NischQ80TM9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
NischQ80TM9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
NischQ80TM9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
NischQ80TM9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
NischQ80TM9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
NischQ80TM9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC46.31■■■■■ 5
NischQ80TM9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
NischQ80TM9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
NischQ80TM9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
NischQ80TM9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
NischQ80TM9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC46.29■■■■■ 5
NischQ80TM9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
NischQ80TM9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
NischQ80TM9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
NischQ80TM9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
NischQ80TM9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
NischQ80TM9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
NischQ80TM9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
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