Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vtcn1Q7TSP5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vtcn1Q7TSP5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vtcn1Q7TSP5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms