Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf516Q7TSH3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf516Q7TSH3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf516Q7TSH3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf516Q7TSH3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf516Q7TSH3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf516Q7TSH3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf516Q7TSH3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf516Q7TSH3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf516Q7TSH3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms