Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dsg1cQ7TSF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms