Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcg2Q7TMS5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcg2Q7TMS5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg2Q7TMS5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms