Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usmg5Q78IK2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usmg5Q78IK2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usmg5Q78IK2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usmg5Q78IK2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usmg5Q78IK2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usmg5Q78IK2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms