Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mvb12aQ78HU3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mvb12aQ78HU3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mvb12aQ78HU3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms