Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms