Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpopQ6ZWS8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpopQ6ZWS8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms