Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp2r2bQ6ZWR4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms