Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zc3h4Q6ZPZ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms