Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ino80Q6ZPV2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ino80Q6ZPV2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ino80Q6ZPV2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ino80Q6ZPV2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ino80Q6ZPV2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms