Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd4Q6ZPR5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms