Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp2c54Q6XVG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c54Q6XVG2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c54Q6XVG2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms