Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bnip1Q6QD59 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip1Q6QD59 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms