Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HjurpQ6PG16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HjurpQ6PG16 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HjurpQ6PG16 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms