Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup98Q6PFD9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Nup98Q6PFD9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms