Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE87

Cfap206, Cilia- and flagella-associated protein 206, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap206Q6PE87 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cfap206Q6PE87 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cfap206Q6PE87 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cfap206Q6PE87 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cfap206Q6PE87 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cfap206Q6PE87 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms