Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm2lQ6PDS0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249 ms