Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarcc2Q6PDG5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms