Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim37Q6PCX9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim37Q6PCX9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms