Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Gapvd1Q6PAR5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Gapvd1Q6PAR5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gapvd1Q6PAR5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Gapvd1Q6PAR5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms