Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtss1lQ6P9S0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtss1lQ6P9S0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtss1lQ6P9S0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms